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root権限無しにPythonモジュールをインストールする

Pythonでは virtualenv を使う事でroot権限無しにモジュールのインストールが出来るようになる．目的別に環境を作る事が出来るので，モジュールを試しにインストールする時にも有用．

virtualenvのインストール

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#include <avr/io.h>
#include <avr/boot.h>
#include <util/delay.h>
#include <avr/signature.h>
#include <avr/pgmspace.h>
#include <stdint.h>
#include <stdbool.h>
#include <avr/eeprom.h>

// #include <usart.h>

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Rのインストール

1. 一番簡単な方法

---

R for mac から R-3.x.x.pkg (latest version) をダウンロードする．

この方法の場合には Xcode や Xquartz をインストールする必要はコンパイルが必要なモジュールを入れない限り無い． モジュールをインストールする場合にはコンパイルが必要な事があるので MacPorts を使う方法の1〜3をやっておくと良い．

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#!/usr/bin/env python

__author__ = 'OKAMURA Yasunobu'
__license__ = 'GPLv3+'

from Bio import Entrez
import argparse
import re
from xml.sax.saxutils import escape

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# -*- shell-script -*-

# private paths
if [ -f $HOME/.zsh.d/private-path.sh ];then
    source $HOME/.zsh.d/private-path.sh
fi

# load system configuration
if [ -f "/etc/profile" ];then
    source /etc/profile

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#!/bin/bash

DOTFILES=`find "$PWD" -mindepth 1 -maxdepth 1 -name "dot_*"`
TIME=`LANG=C date`

pushd "$HOME"

for i in $DOTFILES;do
    NEWNAME=`basename "$i" | sed -e "s|^dot_|$HOME/.|"`
    if [ -L "$NEWNAME" ];then

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#!/usr/bin/env python

import Bio.SeqIO
import argparse
import re
import os.path

def cleanup_text(name):
    """
    

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#!/bin/sh
# -*- sh -*-

#: =cut
#
#=head1 NAME
#
#load - Plugin to monitor the memory on a system.
#
#=head1 AUTHOR

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#!/bin/sh
#$ -S /bin/sh
#$ -cwd

if [ "$JOB_ID" ];then # in grid engine
    tar "$@"
else
    qsub -N "qtar-`basename $PWD`" -l s_vmem=0.5G,mem_req=0.5 $0 "$@"
fi

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#!/usr/bin/env python

import argparse
import sqlite3
import csv
import gzip
import bz2
import datetime

def prepare_database(conn):