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João Cavalcante jvfe

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@jvfe
jvfe / GSoC2021.md
Last active August 22, 2021 20:57
GSoC 2021 Project Summary - R Community Explorer - Exploration of the R community on Twitter
@jvfe
jvfe / snippet.nf
Created February 1, 2023 17:47
Difference between using mix and set with value channels
ch = Channel.empty()
ch2 = Channel.empty()
ch = ch.mix(Channel.value('database'))
Channel.value('database').set{ ch2 }
println(ch)
println(ch2)
@jvfe
jvfe / Nextflow_on_NPAD_UFRN.md
Last active May 19, 2025 15:58 — forked from iaradsouza1/Nextflow_on_NPAD_UFRN.md
Run Nextflow pipelines and RStudio at NPAD local cluster

Este é um guia básico para configurar algumas configurações básicas para executar pipelines Nextflow no NPAD.

Primeiro, estou assumindo que sua análise ocupará mais de 9 GB (sua cota de espaço no diretório home), então você precisará usar o disco scratch para armazenar os resultados e as imagens Singularity.

0. Instalar conda e nf-core

Aqui, recomendo usar o conda para instalar o Nextflow e o nf-core.

Baixe e instale o conda: https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html