Sphinx はドキュメントを作成するツールで, Pygments は Sphinx 内部で使われているシンタックスハイライタです.
Pygments を使用して独自のハイライティングをする方法は, チュートリアルあるいはソースコードを読むのがいちばん手っ取り 早いでしょう. http://pygments.org/docs/lexerdevelopment/ とか, https://bitbucket.org/birkenfeld/pygments-main/src/0442d3cf660124048efde3c0d72ff79ea0355040/pygments/lexers?at=default などを読めば,レクサをつくってシンタックスハイライタをつくる方法が