同じドメイン内で、ディレクトリによって国や言語を振り分けている場合、alternate属性値とhreflang属性を指定して紐付けます。
言語や地域の URL に hreflang を使用する https://support.google.com/webmasters/answer/189077?hl=ja
<link rel="alternate" hreflang="ja" href="https://www.example.com/">
<link rel="alternate" hreflang="en" href="https://www.example.com/en/">