Vai que é tua

Program.cs

using System;
using System.Collections.Generic;
using System.Linq;

namespace MegaLinqTeste
{
    class Program
    {
        static void Main(string[] args)
        {
            var aPatirDe = new DateTime(2015, 6, 1);

            var list = Query().ToList();

            var contratos = (from contrato in list
                             from car in contrato.ContasAReceber
                             from vencimento in car.Vencimentos
                             let maxData = contrato.ContasAReceber.SelectMany(c => c.Vencimentos).Max(v => v.Data)
                             where vencimento.Data == maxData && vencimento.Valor == vencimento.Baixas.Sum(b => b.ValorNominal)
                             select contrato)
                            .Distinct()
                            .ToList();

            foreach (var contrato in contratos)
            {
                Console.WriteLine(contrato.Descricao);
            }
        }

        private static IEnumerable<Contrato> Query()
        {
            yield return GeraContrato("Contrato a ser cobrado 1", 6, true, aPartirDoMes: 3);
            yield return GeraContrato("Contrato sem cobrança 1");
            yield return GeraContrato("Contrato a ser cobrado 2", 3, true, aPartirDoMes: 5);
            yield return GeraContrato("Contrato sem cobrança 2", aPartirDoMes: 5);
            yield return GeraContrato("Contrato sem cobrança 3", aPartirDoMes: 5);
        }

        private static Contrato GeraContrato(string descricao, int contasPagas = 1, bool contaEmAberto = true, int aPartirDoMes = 1)
        {
            var contrato = new Contrato(descricao);
            for (var i = 0; i < contasPagas; i++)
                contrato.ContasAReceber.Add(GeraContaAReceber(new DateTime(2015, aPartirDoMes + i, 1)));
            if (contaEmAberto)
                contrato.ContasAReceber.Add(GeraContaAReceber(new DateTime(2015, aPartirDoMes + contasPagas + 1, 1), false));
            return contrato;
        }

        private static ContaAReceber GeraContaAReceber(DateTime data, bool pago = true)
        {
            var contaAReceber = new ContaAReceber();
            contaAReceber.Vencimentos.Add(GeraVencimento(data, pago));
            return contaAReceber;
        }

        private static Vencimento GeraVencimento(DateTime data, bool pago = true)
        {
            var vencimento = new Vencimento { Data = data };
            if (pago) vencimento.Baixas.Add(new Baixa());
            return vencimento;
        }
    }

    public class Contrato
    {
        public string Descricao { get; set; }

        public Contrato(string descricao)
        {
            Descricao = descricao;
        }

        public override string ToString()
        {
            return Descricao;
        }

        public IList<ContaAReceber> ContasAReceber { get; set; } = new List<ContaAReceber>();
    }

    public class ContaAReceber
    {
        public IList<Vencimento> Vencimentos { get; set; } = new List<Vencimento>();
    }

    public class Vencimento
    {
        public decimal Valor { get; set; } = 100;
        public IList<Baixa> Baixas { get; set; } = new List<Baixa>();
        public DateTime Data { get; set; }
    }

    public class Baixa
    {
        public decimal ValorNominal { get; set; } = 100;
    }
}

Boa , esta era a abordagem que ia sugerir 😃 pegar direto do conta a receber do contrato