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April 16, 2018 22:24
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PSF CMAP | |
7 !NTITLE | |
REMARKS original generated structure x-plor psf file | |
REMARKS 2 patches were applied to the molecule. | |
REMARKS topology C:/Users/joaor/Downloads/toppar/top_all36_prot.rtf | |
REMARKS topology C:/Users/joaor/Downloads/toppar/top_all22_prot.rtf | |
REMARKS segment A { first ACE; last CT3; auto angles dihedrals } | |
REMARKS patch CT3 A:27 | |
REMARKS patch ACE A:1 | |
450 !NATOM | |
1 A 1 MET CAY CT3 -0.270000 12.0110 0 | |
2 A 1 MET HY1 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
3 A 1 MET HY2 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
4 A 1 MET HY3 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
5 A 1 MET CY C 0.510000 12.0110 0 | |
6 A 1 MET OY O -0.510000 15.9990 0 | |
7 A 1 MET N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
8 A 1 MET HN H 0.310000 1.0080 0 | |
9 A 1 MET CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
10 A 1 MET HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
11 A 1 MET CB CT2 -0.180000 12.0110 0 | |
12 A 1 MET HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
13 A 1 MET HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
14 A 1 MET CG CT2 -0.140000 12.0110 0 | |
15 A 1 MET HG1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
16 A 1 MET HG2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
17 A 1 MET SD S -0.090000 32.0600 0 | |
18 A 1 MET CE CT3 -0.220000 12.0110 0 | |
19 A 1 MET HE1 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
20 A 1 MET HE2 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
21 A 1 MET HE3 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
22 A 1 MET C C 0.510000 12.0110 0 | |
23 A 1 MET O O -0.510000 15.9990 0 | |
24 A 2 ASP N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
25 A 2 ASP HN H 0.310000 1.0080 0 | |
26 A 2 ASP CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
27 A 2 ASP HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
28 A 2 ASP CB CT2A -0.280000 12.0110 0 | |
29 A 2 ASP HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
30 A 2 ASP HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
31 A 2 ASP CG CC 0.620000 12.0110 0 | |
32 A 2 ASP OD1 OC -0.760000 15.9990 0 | |
33 A 2 ASP OD2 OC -0.760000 15.9990 0 | |
34 A 2 ASP C C 0.510000 12.0110 0 | |
35 A 2 ASP O O -0.510000 15.9990 0 | |
36 A 3 TYR N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
37 A 3 TYR HN H 0.310000 1.0080 0 | |
38 A 3 TYR CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
39 A 3 TYR HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
40 A 3 TYR CB CT2 -0.180000 12.0110 0 | |
41 A 3 TYR HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
42 A 3 TYR HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
43 A 3 TYR CG CA 0.000000 12.0110 0 | |
44 A 3 TYR CD1 CA -0.115000 12.0110 0 | |
45 A 3 TYR HD1 HP 0.115000 1.0080 0 | |
46 A 3 TYR CE1 CA -0.115000 12.0110 0 | |
47 A 3 TYR HE1 HP 0.115000 1.0080 0 | |
48 A 3 TYR CZ CA 0.110000 12.0110 0 | |
49 A 3 TYR OH OH1 -0.540000 15.9990 0 | |
50 A 3 TYR HH H 0.430000 1.0080 0 | |
51 A 3 TYR CD2 CA -0.115000 12.0110 0 | |
52 A 3 TYR HD2 HP 0.115000 1.0080 0 | |
53 A 3 TYR CE2 CA -0.115000 12.0110 0 | |
54 A 3 TYR HE2 HP 0.115000 1.0080 0 | |
55 A 3 TYR C C 0.510000 12.0110 0 | |
56 A 3 TYR O O -0.510000 15.9990 0 | |
57 A 4 GLN N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
58 A 4 GLN HN H 0.310000 1.0080 0 | |
59 A 4 GLN CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
60 A 4 GLN HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
61 A 4 GLN CB CT2 -0.180000 12.0110 0 | |
62 A 4 GLN HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
63 A 4 GLN HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
64 A 4 GLN CG CT2 -0.180000 12.0110 0 | |
65 A 4 GLN HG1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
66 A 4 GLN HG2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
67 A 4 GLN CD CC 0.550000 12.0110 0 | |
68 A 4 GLN OE1 O -0.550000 15.9990 0 | |
69 A 4 GLN NE2 NH2 -0.620000 14.0070 0 | |
70 A 4 GLN HE21 H 0.320000 1.0080 0 | |
71 A 4 GLN HE22 H 0.300000 1.0080 0 | |
72 A 4 GLN C C 0.510000 12.0110 0 | |
73 A 4 GLN O O -0.510000 15.9990 0 | |
74 A 5 VAL N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
75 A 5 VAL HN H 0.310000 1.0080 0 | |
76 A 5 VAL CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
77 A 5 VAL HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
78 A 5 VAL CB CT1 -0.090000 12.0110 0 | |
79 A 5 VAL HB HA1 0.090000 1.0080 0 | |
80 A 5 VAL CG1 CT3 -0.270000 12.0110 0 | |
81 A 5 VAL HG11 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
82 A 5 VAL HG12 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
83 A 5 VAL HG13 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
84 A 5 VAL CG2 CT3 -0.270000 12.0110 0 | |
85 A 5 VAL HG21 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
86 A 5 VAL HG22 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
87 A 5 VAL HG23 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
88 A 5 VAL C C 0.510000 12.0110 0 | |
89 A 5 VAL O O -0.510000 15.9990 0 | |
90 A 6 SER N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
91 A 6 SER HN H 0.310000 1.0080 0 | |
92 A 6 SER CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
93 A 6 SER HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
94 A 6 SER CB CT2 0.050000 12.0110 0 | |
95 A 6 SER HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
96 A 6 SER HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
97 A 6 SER OG OH1 -0.660000 15.9990 0 | |
98 A 6 SER HG1 H 0.430000 1.0080 0 | |
99 A 6 SER C C 0.510000 12.0110 0 | |
100 A 6 SER O O -0.510000 15.9990 0 | |
101 A 7 SER N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
102 A 7 SER HN H 0.310000 1.0080 0 | |
103 A 7 SER CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
104 A 7 SER HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
105 A 7 SER CB CT2 0.050000 12.0110 0 | |
106 A 7 SER HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
107 A 7 SER HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
108 A 7 SER OG OH1 -0.660000 15.9990 0 | |
109 A 7 SER HG1 H 0.430000 1.0080 0 | |
110 A 7 SER C C 0.510000 12.0110 0 | |
111 A 7 SER O O -0.510000 15.9990 0 | |
112 A 8 PRO N N -0.290000 14.0070 0 | |
113 A 8 PRO CD CP3 0.000000 12.0110 0 | |
114 A 8 PRO HD1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
115 A 8 PRO HD2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
116 A 8 PRO CA CP1 0.020000 12.0110 0 | |
117 A 8 PRO HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
118 A 8 PRO CB CP2 -0.180000 12.0110 0 | |
119 A 8 PRO HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
120 A 8 PRO HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
121 A 8 PRO CG CP2 -0.180000 12.0110 0 | |
122 A 8 PRO HG1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
123 A 8 PRO HG2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
124 A 8 PRO C C 0.510000 12.0110 0 | |
125 A 8 PRO O O -0.510000 15.9990 0 | |
126 A 9 ILE N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
127 A 9 ILE HN H 0.310000 1.0080 0 | |
128 A 9 ILE CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
129 A 9 ILE HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
130 A 9 ILE CB CT1 -0.090000 12.0110 0 | |
131 A 9 ILE HB HA1 0.090000 1.0080 0 | |
132 A 9 ILE CG2 CT3 -0.270000 12.0110 0 | |
133 A 9 ILE HG21 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
134 A 9 ILE HG22 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
135 A 9 ILE HG23 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
136 A 9 ILE CG1 CT2 -0.180000 12.0110 0 | |
137 A 9 ILE HG11 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
138 A 9 ILE HG12 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
139 A 9 ILE CD CT3 -0.270000 12.0110 0 | |
140 A 9 ILE HD1 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
141 A 9 ILE HD2 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
142 A 9 ILE HD3 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
143 A 9 ILE C C 0.510000 12.0110 0 | |
144 A 9 ILE O O -0.510000 15.9990 0 | |
145 A 10 TYR N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
146 A 10 TYR HN H 0.310000 1.0080 0 | |
147 A 10 TYR CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
148 A 10 TYR HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
149 A 10 TYR CB CT2 -0.180000 12.0110 0 | |
150 A 10 TYR HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
151 A 10 TYR HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
152 A 10 TYR CG CA 0.000000 12.0110 0 | |
153 A 10 TYR CD1 CA -0.115000 12.0110 0 | |
154 A 10 TYR HD1 HP 0.115000 1.0080 0 | |
155 A 10 TYR CE1 CA -0.115000 12.0110 0 | |
156 A 10 TYR HE1 HP 0.115000 1.0080 0 | |
157 A 10 TYR CZ CA 0.110000 12.0110 0 | |
158 A 10 TYR OH OH1 -0.540000 15.9990 0 | |
159 A 10 TYR HH H 0.430000 1.0080 0 | |
160 A 10 TYR CD2 CA -0.115000 12.0110 0 | |
161 A 10 TYR HD2 HP 0.115000 1.0080 0 | |
162 A 10 TYR CE2 CA -0.115000 12.0110 0 | |
163 A 10 TYR HE2 HP 0.115000 1.0080 0 | |
164 A 10 TYR C C 0.510000 12.0110 0 | |
165 A 10 TYR O O -0.510000 15.9990 0 | |
166 A 11 ASP N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
167 A 11 ASP HN H 0.310000 1.0080 0 | |
168 A 11 ASP CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
169 A 11 ASP HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
170 A 11 ASP CB CT2A -0.280000 12.0110 0 | |
171 A 11 ASP HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
172 A 11 ASP HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
173 A 11 ASP CG CC 0.620000 12.0110 0 | |
174 A 11 ASP OD1 OC -0.760000 15.9990 0 | |
175 A 11 ASP OD2 OC -0.760000 15.9990 0 | |
176 A 11 ASP C C 0.510000 12.0110 0 | |
177 A 11 ASP O O -0.510000 15.9990 0 | |
178 A 12 ILE N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
179 A 12 ILE HN H 0.310000 1.0080 0 | |
180 A 12 ILE CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
181 A 12 ILE HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
182 A 12 ILE CB CT1 -0.090000 12.0110 0 | |
183 A 12 ILE HB HA1 0.090000 1.0080 0 | |
184 A 12 ILE CG2 CT3 -0.270000 12.0110 0 | |
185 A 12 ILE HG21 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
186 A 12 ILE HG22 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
187 A 12 ILE HG23 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
188 A 12 ILE CG1 CT2 -0.180000 12.0110 0 | |
189 A 12 ILE HG11 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
190 A 12 ILE HG12 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
191 A 12 ILE CD CT3 -0.270000 12.0110 0 | |
192 A 12 ILE HD1 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
193 A 12 ILE HD2 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
194 A 12 ILE HD3 HA3 0.090000 1.0080 0 | |
195 A 12 ILE C C 0.510000 12.0110 0 | |
196 A 12 ILE O O -0.510000 15.9990 0 | |
197 A 13 ASN N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
198 A 13 ASN HN H 0.310000 1.0080 0 | |
199 A 13 ASN CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
200 A 13 ASN HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
201 A 13 ASN CB CT2 -0.180000 12.0110 0 | |
202 A 13 ASN HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
203 A 13 ASN HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
204 A 13 ASN CG CC 0.550000 12.0110 0 | |
205 A 13 ASN OD1 O -0.550000 15.9990 0 | |
206 A 13 ASN ND2 NH2 -0.620000 14.0070 0 | |
207 A 13 ASN HD21 H 0.320000 1.0080 0 | |
208 A 13 ASN HD22 H 0.300000 1.0080 0 | |
209 A 13 ASN C C 0.510000 12.0110 0 | |
210 A 13 ASN O O -0.510000 15.9990 0 | |
211 A 14 TYR N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
212 A 14 TYR HN H 0.310000 1.0080 0 | |
213 A 14 TYR CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
214 A 14 TYR HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
215 A 14 TYR CB CT2 -0.180000 12.0110 0 | |
216 A 14 TYR HB1 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
217 A 14 TYR HB2 HA2 0.090000 1.0080 0 | |
218 A 14 TYR CG CA 0.000000 12.0110 0 | |
219 A 14 TYR CD1 CA -0.115000 12.0110 0 | |
220 A 14 TYR HD1 HP 0.115000 1.0080 0 | |
221 A 14 TYR CE1 CA -0.115000 12.0110 0 | |
222 A 14 TYR HE1 HP 0.115000 1.0080 0 | |
223 A 14 TYR CZ CA 0.110000 12.0110 0 | |
224 A 14 TYR OH OH1 -0.540000 15.9990 0 | |
225 A 14 TYR HH H 0.430000 1.0080 0 | |
226 A 14 TYR CD2 CA -0.115000 12.0110 0 | |
227 A 14 TYR HD2 HP 0.115000 1.0080 0 | |
228 A 14 TYR CE2 CA -0.115000 12.0110 0 | |
229 A 14 TYR HE2 HP 0.115000 1.0080 0 | |
230 A 14 TYR C C 0.510000 12.0110 0 | |
231 A 14 TYR O O -0.510000 15.9990 0 | |
232 A 15 TYR N NH1 -0.470000 14.0070 0 | |
233 A 15 TYR HN H 0.310000 1.0080 0 | |
234 A 15 TYR CA CT1 0.070000 12.0110 0 | |
235 A 15 TYR HA HB1 0.090000 1.0080 0 | |
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455 !NBOND: bonds | |
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817 !NTHETA: angles | |
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449 447 450 | |
1199 !NPHI: dihedrals | |
1 5 7 8 1 5 7 9 | |
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8 7 9 10 9 22 24 25 | |
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22 24 26 27 23 22 24 25 | |
23 22 24 26 24 26 28 31 | |
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446 445 447 450 | |
79 !NIMPHI: impropers | |
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22 9 24 23 24 22 26 25 | |
31 28 33 32 34 26 36 35 | |
36 34 38 37 55 38 57 56 | |
57 55 59 58 67 69 64 68 | |
67 64 69 68 69 67 70 71 | |
69 67 71 70 72 59 74 73 | |
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90 88 92 91 99 92 101 100 | |
101 99 103 102 110 103 112 111 | |
112 110 116 113 124 116 126 125 | |
126 124 128 127 143 128 145 144 | |
145 143 147 146 164 147 166 165 | |
166 164 168 167 173 170 175 174 | |
176 168 178 177 178 176 180 179 | |
195 180 197 196 197 195 199 198 | |
204 206 201 205 204 201 206 205 | |
206 204 207 208 206 204 208 207 | |
209 199 211 210 211 209 213 212 | |
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265 255 267 266 267 265 269 268 | |
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293 291 297 294 305 297 307 306 | |
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376 374 378 377 383 385 380 384 | |
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406 404 408 407 426 408 428 427 | |
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0 0 | |
1 0 !NGRP | |
0 0 0 | |
27 !NCRTERM: cross-terms | |
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22 24 26 34 24 26 34 36 | |
34 36 38 55 36 38 55 57 | |
55 57 59 72 57 59 72 74 | |
72 74 76 88 74 76 88 90 | |
88 90 92 99 90 92 99 101 | |
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110 112 116 124 112 116 124 126 | |
124 126 128 143 126 128 143 145 | |
143 145 147 164 145 147 164 166 | |
164 166 168 176 166 168 176 178 | |
176 178 180 195 178 180 195 197 | |
195 197 199 209 197 199 209 211 | |
209 211 213 230 211 213 230 232 | |
230 232 234 251 232 234 251 253 | |
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276 278 280 291 278 280 291 293 | |
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333 335 337 355 335 337 355 357 | |
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374 376 378 388 376 378 388 390 | |
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404 406 408 426 406 408 426 428 | |
426 428 430 443 428 430 443 445 | |
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