Much R packages

much_packages.R

packages <- c("abind", "acepack", "actuar", "ActuDistns", "ada", 
"adabag", "addinplots", "ade4", 
"ade4TkGUI", "adegraphics", "adehabitatLT", "adehabitatMA", "ADGofTest", 
"AER", "AGD", "agricolae", "AICcmodavg", "akima", "alabama", 
"AlgDesign", "alphahull", "alr3", "alr4", "amap", "Amelia", "anchors", 
"animation", "aod", "aods3", "ape", "aplpack", 
"argparse", "arm", "arules", "arulesViz", "ascii", 
"assertthat", "AUC", "BaBooN", "backports", "barcode", "bartMachine", 
"bartMachineJARs", "base64", "base64enc", "BatchJobs", 
"BayesFactor", "bayesplot", "BayesX", "BayesXsrc", "BB", "BBmisc", 
"bbmle", "BCA", "bcp", "bdsmatrix", "betareg", "BH", "BHH2", 
"BiasedUrn", "bibtex", "biclust", "BIFIEsurvey", "biganalytics", 
"biglm", "bigmemory", "bigmemory.sri", "bigRR", "bigtabulate", 
"binda", "binGroup", "bisoreg", "bit", "bit64", "bitops", "blme", 
"BMA", "boot", "bootstrap", "Boruta", "BradleyTerry2", "breakpoint", 
"brew", "brglm", "brnn", "broom", "BsMD", "bst", "btergm", "C50", 
"ca", "Cairo", "cairoDevice", "CALIBERrfimpute", "calibrator", 
"candisc", "caper", "car", "CARBayes", "CARBayesdata", "care", 
"caret", "caretEnsemble", "catdata", "caTools", "cba", "ccaPP", 
"cclust", "CDM", "CDVine", "cellranger", "cem", "censReg", "CEoptim", 
"changepoint", "checkmate", "checkpoint", "chemometrics", "chron", 
"circlize", "CircStats", "Ckmeans.1d.dp", "class", "classInt", 
"clue", "cluster", "clusterSim", "clustvarsel", "clv", "clValid", 
"cmaes", "cmprsk", "coda", "codetools", "coin", "colorplaner", 
"colorspace", "combinat", "commonmark", 
"CompQuadForm", "compute.es", "conf.design", "contfrac", 
"contrast", "copula", "CORElearn", "corpcor", "corrgram", "corrplot", 
"covr", "CoxBoost", "coxme", "cplm", "crayon", "crosstalk", "crossval", 
"crp.CSFP", "crrstep", "crs", "cshapes", "cubature", "Cubist", 
"curl", "cvAUC", "cvTools", "d3heatmap", "d3Network", "DAAG", 
"data.table", "data.tree", "DatABEL", "datacomb", "dataframes2xls", 
"date", "dbConnect", "DBI", "dbscan", "Deducer", 
"DeducerExtras", "deepnet", "degreenet", "deldir", "dendextend", 
"dendroextras", "DendSer", "denstrip", "DEoptim", "DEoptimR", 
"depthTools", "Deriv", "desc", "descr", "DescTools", "deSolve", 
"Devore7", "devtools", "dfoptim", "diagram", "DiagrammeR", "DiagrammeRsvg", 
"DiceDesign", "DiceKriging", "DiceOptim", "dichromat", "digest", 
"diptest", "directlabels", "discretization", "DiscriMiner", "distr", 
"distrEx", "DistributionUtils", "diveMove", "dlm", "DMwR", "doBy", 
"DoE.base", "DoE.wrapper", "doMPI", "doParallel", "doRedis", 
"DoseFinding", "downloader", "dplR", "dplyr", "drat", "DT", "dtplyr", 
"dtw", "dygraphs", "dynamicTreeCut", "dynlm", "e1071", "eaf", 
"earth", "Ecdat", "Ecfun", "ecodist", "effects", "eha", "elasticnet", 
"ElemStatLearn", "ellipse", "elliptic", "elmNN", "emdbook", "emoa", 
"emulator", "energy", "ENmisc", "EnQuireR", "entropy", "EntropyExplorer", 
"Epi", "EpiModel", "epitools", "erer", "ergm", "ergm.count", 
"ergm.userterms", "eRm", "estimability", "etm", "evaluate", "evd", 
"expint", "ExplainPrediction", "expm", "extrafont", "extrafontdb", 
"extraTrees", "factoextra", "FactoMineR", "Fahrmeir", "fail", 
"faraway", "fArma", "fAsianOptions", "fAssets", "fastcluster", 
"fastdigest", "fastICA", "fastmatch", "fastR", "fBasics", "fCopulae", 
"fda", "fdrtool", "FeaLect", "feather", "FeatureHashing", "fExoticOptions", 
"fExtremes", "ff", "ffbase", "FFTrees", "fftw", "fGarch", "fields", 
"filehash", "fImport", "findpython", "fit.models", "fitdistrplus", 
"flare", "flashClust", "flexclust", "flexdashboard", "flexmix", 
"flexsurv", "FME", "FMStable", "fMultivar", "FNN", "fNonlinear", 
"fontcm", "fOptions", "foreach", "forecast", "formatR", 
"formattable", "Formula", "fortunes", "forward", "fpc", "fPortfolio", 
"fracdiff", "FRB", "frbs", "fRegression", "FrF2", "FrF2.catlg128", 
"FSelector", "fTrading", "fts", "futile.logger", "futile.options", 
"GA", "gam", "gamair", "GAMBoost", "gamboostLSS", "gamlss", "gamlss.data", 
"gamlss.dist", "gamm4", "gapminder", "gbm", "gclus", "gdata", 
"gdtools", "gee", "geeM", "geepack", "GenABEL", "GenABEL.data", 
"GeneralizedHyperbolic", "genetics", "GenSA", "geoR", "geoRglm", 
"geosphere", "GERGM", "getopt", "GGally", "ggcorrplot", "ggdendro", 
"ggfortify", "ggiraph", "ggm", "ggplot2", "ggplot2movies", 
"ggpubr", "ggrepel", "ggsci", "ggthemes", "ggvis", 
"git2r", "glasso", "glmmML", "glmnet", 
"glmulti", "GlobalOptions", "gmailr", "Gmedian", "gmm", "gmodels", 
"gmp", "gnm", "gof", "goftest", "googleVis", "gpairs", "GPArotation", 
"GPfit", "gplots", "gRbase", 
"grid", "gridBase", "gridExtra", "grouped", "gsl", "gss", "gstat", 
"gsubfn", "gtable", "gtools", "Guerry", "gWidgets", "gWidgetsRGtk2", 
"gWidgetstcltk", "h2o", "haplo.stats", "haven", "hdi", "heatmaply", 
"heplots", "hergm", "hexbin", "hglm", "hglm.data", "HH", "HiClimR", 
"highlight", "highr", "hmeasure", "Hmisc", "hms", "HSAUR", "HSAUR2", 
"HSAUR3", "htmlTable", "htmltools", "htmlwidgets", "httpuv", 
"httr", "huge", "hunspell", "hwriter", "hypergeo", "ibdreg", 
"ic.infer", "ICS", "ICSNP", "igraph", "igraphdata", "import", 
"ineq", "influenceR", "Information", "infotheo", "inline", "inlinedocs", 
"intergraph", "intervals", "intsvy", "iplots", "ipred", "irace", 
"irlba", "irr", "isa2", "Iso", "ISOcodes", "isotone", "ISwR", 
"iterators", "itertools", "JavaGD", "JGR", "jomo", "jpeg", "jsonlite", 
"kappalab", "kdecopula", "Kendall", "kernlab", "KernSmooth", 
"KFAS", "kinship2", "kknn", "klaR", "kmi", "knitcitations", "knitr", 
"kohonen", "koRpus", "ks", "labeling", "labelled", "labeltodendro", 
"laeken", "LaF", "laGP", "Lahman", "lambda.r", "largeVis", "lars", 
"lasso2", "latentnet", "lattice", "latticeExtra", "lava", 
"lava.tobit", "lavaan", "lavaan.survey", "lawstat", "lazyeval", 
"LCA", "lcopula", "leaflet", "leaps", "LearnBayes", "lfda", "lfe", 
"lhs", "LiblineaR", "likert", "limoaddin", 
"linprog", "lintr", "lisrelToR", "lme4", "lmerTest", 
"lmodel2", "lmtest", "loa", "locfit", "logcondens", "LogicReg", 
"logistf", "logspline", "lokern", "longmemo", "loo", "lpSolve", 
"lpSolveAPI", "lqa", "lqmm", "lsmeans", "lubridate", "MAc", "MAd", 
"magrittr", "mail", "manipulate", "mapdata", "mapproj", "maps", 
"maptools", "maptree", "markdown", "MASS", "Matching", "MatchIt", 
"mathgraph", "matlab", "Matrix", "matrixcalc", "MatrixModels", 
"matrixStats", "maxLik", "maxlike", "MBA", "MBESS", "mboost", 
"mc2d", "mcclust", "mcgibbsit", "mclust", "mcmc", "MCMCglmm", 
"MCMCpack", "mco", "mda", "MDSGUI", "mediation", "memisc", "memoise", 
"MEMSS", "merTools", "MetABEL", "metafor", "Metrics", 
"mets", "mgcv", "mi", "mice", "miceadds", "microbenchmark", "microplot", 
"mime", "minerva", "miniUI", "minpack.lm", "minqa", "mirt", "mirtCAT", 
"misc3d", "miscTools", "missForest", "missMDA", "mitml", "mitools", 
"mix", "mlbench", "MLmetrics", "mlmRev", "mlogit", "mlr", "mnlogit", 
"mnormt", "modeest", "ModelMetrics", "modelr", "modeltools", 
"mondate", "monreg", "moonBook", "mosaic", "mosaicData", "movMF", 
"MplusAutomation", "mpmi", "MPV", "mratios", "mRMRe", "msm", 
"mstate", "MSwM", "muhaz", "multcomp", "multcompView", "multicool", 
"multiwayvcov", "MuMIn", "munsell", "mvinfluence", "mvnormtest", 
"mvoutlier", "mvtnorm", "NbClust", "ncdf4", "ncvreg", 
"ndtv", "network", "networkD3", "networkDynamic", "networkDynamicData", 
"networksis", "neuralnet", "NeuralNetTools", "NHANES", "nlme", 
"nloptr", "NLP", "NMF", "nnet", "nnls", "nodeHarvest", "nor1mix", 
"norm", "nortest", "np", "numDeriv", "nws", "nycflights13", "obliqueRF", 
"odfWeave", "officer", "OpenMx", "openssl", "optextras", "optimx", 
"optmatch", "orcutt", "ordinal", "ore", "orloca", "orloca.es", 
"orthopolynom", "outliers", "oz", "packrat", "pamr", "pan", "pander", 
"parallel", "parallelMap", "ParamHelpers", "partitions", "party", 
"partykit", "pastecs", "pbapply", "pbivnorm", "pbkrtest", "PBSmapping", 
"PBSmodelling", "pcalg", "pcaPP", "pec", "penalized", "PerformanceAnalytics", 
"permute", "pgirmess", "pixmap", "pkgKitten", "pkgmaker", "PKI", 
"PKPDmodels", "playwith", "plm", "plogr", "plot3D", "plotly", 
"plotmo", "plotrix", "pls", "plyr", "PMCMR", "pmml", "pmmlTransformations", 
"png", "poistweedie", "poLCA", "polspline", "polyclip", "polycor", 
"polynom", "prabclus", "pracma", "praise", "PredictABEL", "prefmod", 
"prettyunits", "prim", "pROC", "prodlim", "profdpm", "profileModel", 
"progress", "propagate", "proto", "proxy", "pryr", "pscl", "pso", 
"pspline", "psych", "psychotools", "psychotree", "purrr", "pvclust", 
"pwr", "qap", "qcc", "qgraph", "qrng", "quadprog", 
"quantmod", "quantreg", "qvcalc", "R.cache", "R.devices", 
"R.matlab", "R.methodsS3", "R.oo", "R.rsp", "R.utils", "R2BayesX", 
"R2Cuba", "R2HTML", "R2jags", "R2OpenBUGS", "R2PPT", "R2wd", 
"R2WinBUGS", "R6", "radiant", "radiant.basics", "radiant.data", 
"radiant.design", "radiant.model", "radiant.multivariate", "RandomFields", 
"RandomFieldsUtils", "randomForest", "randomForestSRC", "randtests", 
"randtoolbox", "ranger", "RankAggreg", "RANN", "rappdirs", "RArcInfo", 
"rARPACK", "RaschSampler", "raster", "rasterVis", "rattle", "rbenchmark", 
"rbounds", "rbvs", "Rcgmin", "Rcmdr", "RcmdrMisc", "RcmdrPlugin.BCA", 
"RcmdrPlugin.coin", "RcmdrPlugin.depthTools", "RcmdrPlugin.DoE", 
"RcmdrPlugin.doex", "RcmdrPlugin.epack", "RcmdrPlugin.Export", 
"RcmdrPlugin.FactoMineR", "RcmdrPlugin.HH", "RcmdrPlugin.IPSUR", 
"RcmdrPlugin.KMggplot2", "RcmdrPlugin.mosaic", "RcmdrPlugin.orloca", 
"RcmdrPlugin.pointG", "RcmdrPlugin.qual", "RcmdrPlugin.SLC", 
"RcmdrPlugin.sos", "RcmdrPlugin.steepness", "RcmdrPlugin.survival", 
"RcmdrPlugin.TeachingDemos", "RcmdrPlugin.UCA", "RColorBrewer", 
"Rcpp", "RcppArmadillo", "RcppCNPy", "RcppDE", "RcppEigen", "RcppParallel", 
"RcppProgress", "RcppRoll", "Rcsdp", "RCurl", "readr", "readxl", 
"recommenderlab", "ref", "RefManageR", "registry", "relaimpo", 
"relations", "relax", "relevent", "reliaR", "relimp", "rem", 
"rematch", "reportr", "reshape", "reshape2", "rex", "rFerns", 
"rgdal", "rgenoud", "rgeos", "rgexf", "rggobi", "rgl", "Rglpk", 
"rglwidget", "RgoogleMaps", "rgp", "rgpui", "RGtk2", "RGtk2Extras", 
"RH2", "rio", "riskRegression", "RItools", "rjags", "rJava", 
"RJDBC", "rjson", "RJSONIO", "rknn", "rlecuyer", "rmarkdown", 
"rmeta", "Rmpfr", "Rmpi", "rms", "RMySQL", "rneos", "rngtools", 
"rngWELL", "robCompositions", "robust", "robustbase", "rockchalk", 
"ROCR", "RODBC", "Rook", "rootSolve", "rotationForest", "roxygen2", 
"rpanel", "rpart", "rpart.plot", "rpf", "rpivotGadget", "rpivotTable", 
"RPostgreSQL", "rprojroot", "rrcov", "rredis", "RRF", "rrlda", 
"RSclient", "rsconnect", "Rserve", "RSiena", "RSKC", "rsm", "RSNNS", 
"Rsolnp", "RSpectra", "RSQLite", "rstan", "rstanarm", "rstantools", 
"rstudioapi", "rsvg", "Rsymphony", "rtiff", 
"Rtsne", "Rttf2pt1", "rugarch", "RUnit", "Runuran", "rversions", 
"rvest", "rvg", "Rvmmin", "RWeka", "RWekajars", "Ryacas", "sampleSelection", 
"sampling", "sandwich", "scagnostics", "scales", "scalreg", "scatterplot3d", 
"scrypt", "sda", "SEL", "selectr", "sem", "semiArtificial", "semPlot", 
"semTools", "sendmailR", "sendplot", "SensoMineR", "seriation", 
"setRNG", "sets", "sfsmisc", "sgeostat", "shape", "shapefiles", 
"shapes", "shiny", "shinyAce", "shinyCustom", "shinyjs", "shinystan", 
"shinythemes", "signal", "SimComp", "SimDesign", "simecol", "simex", 
"simsem", "sirt", "SIS", "sjmisc", "sjPlot", "sjstats", "SkewHyperbolic", 
"skmeans", "slackr", "slam", "SLC", "Sleuth2", "sm", "smbinning", 
"sn", "sna", "snow", "SnowballC", "snowfall", "snowFT", "som", 
"soma", "sos", "sourcetools", "sp", "spacetime", "spam", "sparcl", 
"SparseGrid", "sparseLDA", "SparseM", "spatial", 
"spatstat", "spatstat.utils", "spc", "spd", "spdep", "speedglm", 
"sphet", "splancs", "splines", "splm", "spls", "sqldf", "sROC", 
"stabledist", "stabs", "StanHeaders", "startupmsg", "StatMatch", 
"statmod", "statnet", "statnet.common", "stats4", "steepness", 
"stepPlr", "stringdist", "stringi", "stringr", "strucchange", 
"subselect", "subsemble", "sudoku", "SuperLearner", "superpc", 
"SuppDists", "survey", "survival", "svd", "svglite", "svGUI", 
"svUnit", "svyPVpack", "SwarmSVM", "SweaveListingUtils", "systemfit", 
"tables", "tabplot", "tabplotd3", "TAM", "tcltk2", "tclust", 
"TeachingDemos", "tensor", "tensorA", "tergm", "testit", "testthat", 
"texreg", "tgp", "TH.data", "threejs", "tibble", "tidyr", 
"tikzDevice", "timeDate", "timereg", "timeSeries", "tis", "tkrplot", 
"tm", "tmvtnorm", "tnam", "TransferEntropy", 
"tree", "trimcluster", "tripack", "truncdist", "truncnorm", "truncreg", 
"trust", "TSA", "tseries", "tseriesEntropy", "tsna", "TSP", "TTR", 
"tufte", "tuneR", "tweedie", "ucminf", "uniReg", "unmarked", 
"urca", "uuid", "V8", "VariABEL", "VarianceGamma", "vars", 
"vcd", "vcdExtra", "Vdgraph", "vegan", "verification", "VGAM", 
"VGAMdata", "VIM", "VIMGUI", "VineCopula", "vioplot", "viridis", 
"viridisLite", "visNetwork", "vtreat", "wavelets", "waveslim", 
"wbstats", "webp", "webshot", "WGCNA", "WhatIf", "whisker", "whoami", 
"withr", "wordcloud", "WrightMap", 
"WriteXLS", "wskm", "wsrf", "xergm", "xergm.common", 
"xkcd", "XLConnect", "XLConnectJars", "XML", "xml2", "xtable", 
"xts", "YaleToolkit", "yaml", "yarrr", "Zelig", "zip", "zipcode", 
"zoo", "ztable")

install.packages(packages)

install.packages("jsonlite")
install.packages("curl")
install.packages(c("Cubist", "rasterVis", "RSQLite"))

install.packages("data.table", type = "source", repos = "http://Rdatatable.github.io/data.table")
install.packages("https://cran.r-project.org/src/contrib/Archive/tabplot/tabplot_1.1.tar.gz", repos=NULL, type="source")
devtools::install_github("Laurae2/woe")
devtools::install_github("Laurae2/sparsity") # FAILS
devtools::install_github("twitter/AnomalyDetection")
devtools::install_github('cmpolis/datacomb', subdir='pkg', ref='1.1.2')
devtools::install_github(c("ramnathv/htmlwidgets", "smartinsightsfromdata/rpivotTable"))
devtools::install_github('rstudio/leaflet')
install.packages(c("dygraphs", "networkD3"))
devtools::install_github('rstudio/DT')
devtools::install_github("bwlewis/rthreejs")
install.packages(c("addinslist", "colourpicker", "ggExtra", "ggThemeAssist", "questionr", "citr", "QRAGadget", "gitgadget"))
devtools::install_github("tjmahr/WrapRmd")
devtools::install_github("MangoTheCat/tidyshiny")
devtools::install_github("homerhanumat/addinplots")
devtools::install_github("Stan125/limoaddin")
devtools::install_github("dkilfoyle/rpivotGadget")
devtools::install_github("csgillespie/addinmanager")
devtools::install_github("YvesCR/arimaUI")
devtools::install_github("benmarwick/wordcountaddin")
devtools::install_github("Stan125/GREA")
devtools::install_github("digital-dharma/RStudioAddIns")
devtools::install_github("ThinkRstat/littleboxes")
install.packages("radiant", repos = "https://radiant-rstats.github.io/minicran/", type = 'binary')
devtools::install_github("sarupurisailalith/commonUtilAddins")
devtools::install_github("haozhu233/giphyr")
devtools::install_github("dracodoc/namebrowser")
devtools::install_github("lorenzwalthert/strcode")
devtools::install_github("Laurae2/ez_xgb/R-package")
devtools::install_github("Laurae2/lgbdl")
lgbdl::lgb.dl(commit = "a8673bd",
              compiler = "vs",
              repo = "https://github.com/Microsoft/LightGBM")
devtools::install_github("Laurae2/Laurae")

install.packages("sparsio", "plotluck", "shinydashboard")