Рассмотрим на примере замера времени поэлементного умножения двух достаточно больших массивов. http://san-tit.blogspot.ru/2016/12/python.html

simpleTimeEstimate.py

import time
import numpy as np

#Генерация случайных массивов по 1000000 элементов
A = np.random.sample((1000, 1000))
B = np.random.sample((1000, 1000))

#Отсечка времени начала
start = time.time()
C = A*B
#Отсечка времени окончания
stop = time.time()
#Вычисление времени выполнения
sec = stop - start
#Вывод времени выполнения
print(sec)