oi.py

# não se preocupa com ocorrências de & como caractere especial
with open('meu_arquivo.xml', 'r') as f:
  content = f.read()
  
with open('meu_novo_arquivo.xml', 'w') as f:
  f.write(content.replace('&', ''))
  
  
# se preocupa > https://www.tjohearn.com/2018/01/24/safe-ampersand-parsing-in-xml-files/

import re 

# captura ocorrências de & que não estão seguidas de amp; lt; ou gt;, configurando uso de & como caractere especial
#    há outros casos, o regex pode estar incompleto, ver > https://stackoverflow.com/a/1091953/3662965
c = re.compile(r'&(?!amp;|lt;|gt;)')

with open('meu_novo_novo_arquivo.xml', 'w') as f:
  # substitui ocorrências de &, de acordo com o regex, por &, que é & escapado
  f.write(c.sub('&', content))