Una corta explicación de bubbleSort para ordenamiento de arreglos. http://youtu.be/v5kLxVtYF9k

BubbleSort

function ordenar(numeros){
  for(var i=0; i<numeros.length; i++){
    numeros[i] = parseInt(numeros[i]);
  }

  for(i=0; i<numeros.length; i++){
    for(var j=0; j<numeros.length-1; j++){
      if(numeros[j] > numeros[j+1]){
        var tmp = numeros[j+1];
        numeros[j+1] = numeros[j];
        numeros[j] = tmp;
      }
    }
  }
  return numeros;
}

var numeros = ordenar(process.argv.slice(2));
console.log(numeros);