gistfile1.txt

# Instalando
sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade
sudo apt-get install nodejs

# Instalando gerenciador de processo
sudo npm install --save pm2
sudo pm2 startup

# Instalando o projeto
cd ~/projeto && git clone https://meu.repo ./
npm install

# Iniciando o projeto
pm2 start ./app.js --name projeto -x

#### Updates

cd ~/projeto && git pull origin master && npm install
pm2 restart projeto

O npm install pode ser rodado como npm install --production para não instalar os pacotes de desenvolvimento, e o pm2 também aceita variáveis do ambiente[1] para iniciar a app em modo de produção.

1 - http://goo.gl/jtn9n7