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@dlight

dlight/gist:6a9b3370f26c314719ee9c5ded3d79ae

Created August 12, 2019 22:15
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gistfile1.txt
$ DISABLE_BLOSC_AVX2=1 conda env create -f environment.yml
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: done
==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
current version: 4.7.10
latest version: 4.7.11
Please update conda by running
$ conda update -n base -c defaults conda
Downloading and Extracting Packages
mistune-0.8.4 | 55 KB | ####################################################################################################### | 100%
sphinx-2.1.2 | 1.4 MB | ####################################################################################################### | 100%
zeromq-4.3.1 | 496 KB | ####################################################################################################### | 100%
multidict-4.5.2 | 137 KB | ####################################################################################################### | 100%
pytools-2019.1.1 | 52 KB | ####################################################################################################### | 100%
libsodium-1.0.16 | 214 KB | ####################################################################################################### | 100%
chardet-3.0.4 | 173 KB | ####################################################################################################### | 100%
appdirs-1.4.3 | 15 KB | ####################################################################################################### | 100%
scipy-1.3.0 | 18.0 MB | ####################################################################################################### | 100%
defusedxml-0.6.0 | 23 KB | ####################################################################################################### | 100%
dask-core-2.2.0 | 573 KB | ####################################################################################################### | 100%
distributed-2.2.0 | 372 KB | ####################################################################################################### | 100%
decorator-4.4.0 | 19 KB | ####################################################################################################### | 100%
pygments-2.4.2 | 664 KB | ####################################################################################################### | 100%
mpc-1.1.0 | 90 KB | ####################################################################################################### | 100%
codecov-2.0.15 | 11 KB | ####################################################################################################### | 100%
jedi-0.13.3 | 245 KB | ####################################################################################################### | 100%
msgpack-python-0.6.1 | 87 KB | ####################################################################################################### | 100%
mkl-2019.4 | 131.2 MB | ####################################################################################################### | 100%
gst-plugins-base-1.1 | 4.8 MB | ####################################################################################################### | 100%
psutil-5.6.3 | 313 KB | ####################################################################################################### | 100%
sphinxcontrib-jsmath | 8 KB | ####################################################################################################### | 100%
blas-1.0 | 6 KB | ####################################################################################################### | 100%
nb_conda_kernels-2.2 | 39 KB | ####################################################################################################### | 100%
matplotlib-3.1.0 | 5.0 MB | ####################################################################################################### | 100%
pytest-cov-2.7.1 | 21 KB | ####################################################################################################### | 100%
expat-2.2.6 | 146 KB | ####################################################################################################### | 100%
frozendict-1.2 | 6 KB | ####################################################################################################### | 100%
babel-2.7.0 | 5.8 MB | ####################################################################################################### | 100%
mkl_fft-1.0.12 | 154 KB | ####################################################################################################### | 100%
pluggy-0.12.0 | 20 KB | ####################################################################################################### | 100%
nbconvert-5.5.0 | 381 KB | ####################################################################################################### | 100%
mkl_random-1.0.2 | 361 KB | ####################################################################################################### | 100%
notebook-6.0.0 | 6.0 MB | ####################################################################################################### | 100%
attrs-19.1.0 | 57 KB | ####################################################################################################### | 100%
ipython-7.7.0 | 1.1 MB | ####################################################################################################### | 100%
gstreamer-1.14.0 | 3.1 MB | ####################################################################################################### | 100%
entrypoints-0.3 | 12 KB | ####################################################################################################### | 100%
cython-0.29.12 | 2.2 MB | ####################################################################################################### | 100%
jpeg-9b | 214 KB | ####################################################################################################### | 100%
ipython_genutils-0.2 | 39 KB | ####################################################################################################### | 100%
docutils-0.15.1 | 737 KB | ####################################################################################################### | 100%
sphinx_rtd_theme-0.4 | 5.1 MB | ####################################################################################################### | 100%
mkl-service-2.0.2 | 65 KB | ####################################################################################################### | 100%
sphinxcontrib-appleh | 29 KB | ####################################################################################################### | 100%
parso-0.5.0 | 67 KB | ####################################################################################################### | 100%
sphinxcontrib-serial | 24 KB | ####################################################################################################### | 100%
markupsafe-1.1.1 | 29 KB | ####################################################################################################### | 100%
cgen-2017.1 | 14 KB | ####################################################################################################### | 100%
certifi-2019.6.16 | 156 KB | ####################################################################################################### | 100%
pyflakes-2.1.1 | 106 KB | ####################################################################################################### | 100%
ptyprocess-0.6.0 | 23 KB | ####################################################################################################### | 100%
pytz-2019.1 | 236 KB | ####################################################################################################### | 100%
alabaster-0.7.12 | 18 KB | ####################################################################################################### | 100%
gmpy2-2.0.8 | 150 KB | ####################################################################################################### | 100%
bleach-3.1.0 | 220 KB | ####################################################################################################### | 100%
pycodestyle-2.5.0 | 61 KB | ####################################################################################################### | 100%
jupyter_core-4.5.0 | 48 KB | ####################################################################################################### | 100%
packaging-19.0 | 39 KB | ####################################################################################################### | 100%
zict-1.0.0 | 12 KB | ####################################################################################################### | 100%
libxcb-1.13 | 421 KB | ####################################################################################################### | 100%
libuuid-1.0.3 | 15 KB | ####################################################################################################### | 100%
zipp-0.5.2 | 8 KB | ####################################################################################################### | 100%
pyrsistent-0.14.11 | 91 KB | ####################################################################################################### | 100%
jsonschema-3.0.1 | 90 KB | ####################################################################################################### | 100%
prompt_toolkit-2.0.9 | 464 KB | ####################################################################################################### | 100%
cloudpickle-1.2.1 | 28 KB | ####################################################################################################### | 100%
pandoc-2.2.3.2 | 14.0 MB | ####################################################################################################### | 100%
cytoolz-0.10.0 | 425 KB | ####################################################################################################### | 100%
py-1.8.0 | 148 KB | ####################################################################################################### | 100%
sphinxcontrib-devhel | 23 KB | ####################################################################################################### | 100%
tornado-6.0.3 | 584 KB | ####################################################################################################### | 100%
send2trash-1.5.0 | 16 KB | ####################################################################################################### | 100%
pyparsing-2.4.0 | 58 KB | ####################################################################################################### | 100%
sympy-1.4 | 7.9 MB | ####################################################################################################### | 100%
more-itertools-7.2.0 | 99 KB | ####################################################################################################### | 100%
sphinxcontrib-htmlhe | 28 KB | ####################################################################################################### | 100%
pyyaml-5.1.1 | 177 KB | ####################################################################################################### | 100%
fontconfig-2.13.0 | 227 KB | ####################################################################################################### | 100%
gmp-6.1.2 | 514 KB | ####################################################################################################### | 100%
toolz-0.10.0 | 50 KB | ####################################################################################################### | 100%
importlib_metadata-0 | 41 KB | ####################################################################################################### | 100%
nbformat-4.4.0 | 128 KB | ####################################################################################################### | 100%
numpy-base-1.16.4 | 3.5 MB | ####################################################################################################### | 100%
traitlets-4.3.2 | 136 KB | ####################################################################################################### | 100%
jupyter_client-5.3.1 | 69 KB | ####################################################################################################### | 100%
pandocfilters-1.4.2 | 13 KB | ####################################################################################################### | 100%
sip-4.19.8 | 274 KB | ####################################################################################################### | 100%
click-7.0 | 120 KB | ####################################################################################################### | 100%
cycler-0.10.0 | 13 KB | ####################################################################################################### | 100%
atomicwrites-1.3.0 | 13 KB | ####################################################################################################### | 100%
python-dateutil-2.8. | 266 KB | ####################################################################################################### | 100%
dbus-1.13.6 | 499 KB | ####################################################################################################### | 100%
sortedcontainers-2.1 | 43 KB | ####################################################################################################### | 100%
wcwidth-0.1.7 | 22 KB | ####################################################################################################### | 100%
coverage-4.5.3 | 219 KB | ####################################################################################################### | 100%
icu-58.2 | 10.3 MB | ####################################################################################################### | 100%
kiwisolver-1.1.0 | 82 KB | ####################################################################################################### | 100%
fastcache-1.1.0 | 30 KB | ####################################################################################################### | 100%
testpath-0.4.2 | 86 KB | ####################################################################################################### | 100%
jinja2-2.10.1 | 195 KB | ####################################################################################################### | 100%
libpng-1.6.37 | 278 KB | ####################################################################################################### | 100%
snowballstemmer-1.9. | 53 KB | ####################################################################################################### | 100%
cached-property-1.5. | 12 KB | ####################################################################################################### | 100%
pickleshare-0.7.5 | 13 KB | ####################################################################################################### | 100%
imagesize-1.1.0 | 9 KB | ####################################################################################################### | 100%
libgfortran-ng-7.3.0 | 1006 KB | ####################################################################################################### | 100%
pyzmq-18.0.0 | 451 KB | ####################################################################################################### | 100%
glib-2.56.2 | 3.9 MB | ####################################################################################################### | 100%
tblib-1.4.0 | 14 KB | ####################################################################################################### | 100%
heapdict-1.0.0 | 8 KB | ####################################################################################################### | 100%
ca-certificates-2019 | 134 KB | ####################################################################################################### | 100%
prometheus_client-0. | 42 KB | ####################################################################################################### | 100%
webencodings-0.5.1 | 19 KB | ####################################################################################################### | 100%
ipykernel-5.1.1 | 167 KB | ####################################################################################################### | 100%
mccabe-0.6.1 | 14 KB | ####################################################################################################### | 100%
numpy-1.16.4 | 48 KB | ####################################################################################################### | 100%
pytest-5.0.1 | 356 KB | ####################################################################################################### | 100%
mpmath-1.1.0 | 766 KB | ####################################################################################################### | 100%
pexpect-4.7.0 | 80 KB | ####################################################################################################### | 100%
nbval-0.9.1 | 20 KB | ####################################################################################################### | 100%
freetype-2.9.1 | 550 KB | ####################################################################################################### | 100%
mpfr-4.0.1 | 429 KB | ####################################################################################################### | 100%
intel-openmp-2019.4 | 729 KB | ####################################################################################################### | 100%
qt-5.9.7 | 68.5 MB | ####################################################################################################### | 100%
python-3.7.4 | 36.0 MB | ####################################################################################################### | 100%
terminado-0.8.2 | 23 KB | ####################################################################################################### | 100%
pyqt-5.9.2 | 4.5 MB | ####################################################################################################### | 100%
sphinxcontrib-qthelp | 26 KB | ####################################################################################################### | 100%
backcall-0.1.0 | 20 KB | ####################################################################################################### | 100%
flake8-3.7.7 | 170 KB | ####################################################################################################### | 100%
pcre-8.43 | 209 KB | ####################################################################################################### | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: / b'Enabling nb_conda_kernels...\nStatus: enabled\n'
done
Ran pip subprocess with arguments:
['/home/a/.conda/envs/devito/bin/python', '-m', 'pip', 'install', '-U', '-r', '/home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt']
Pip subprocess output:
9.1.0
Collecting git+https://github.com/inducer/codepy (from -r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 1))
Cloning https://github.com/inducer/codepy to /tmp/pip-req-build-_ukjzu44
Collecting pyzfp>=0.2 (from -r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 2))
Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/33/ff/1390221dc5ed78eb6573613a76927baeea02c31e73b9db91353b8834bb95/pyzfp-0.3.tar.gz
Collecting pyrevolve>=2.1.3 (from -r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 3))
Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/0d/c4/63a36aa56969de861e181b86ebc1aba6764e9d2566c42e4faf1f360cb3cc/pyrevolve-2.1.3.tar.gz
Collecting py-cpuinfo (from -r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 4))
Collecting anytree>=2.4.3 (from -r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 5))
Requirement already satisfied, skipping upgrade: pytools>=2015.1.2 in /home/a/.conda/envs/devito/lib/python3.7/site-packages (from codepy==2019.1->-r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 1)) (2019.1.1)
Requirement already satisfied, skipping upgrade: numpy>=1.6 in /home/a/.conda/envs/devito/lib/python3.7/site-packages (from codepy==2019.1->-r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 1)) (1.16.4)
Requirement already satisfied, skipping upgrade: appdirs>=1.4.0 in /home/a/.conda/envs/devito/lib/python3.7/site-packages (from codepy==2019.1->-r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 1)) (1.4.3)
Requirement already satisfied, skipping upgrade: six in /home/a/.conda/envs/devito/lib/python3.7/site-packages (from codepy==2019.1->-r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 1)) (1.12.0)
Requirement already satisfied, skipping upgrade: cgen in /home/a/.conda/envs/devito/lib/python3.7/site-packages (from codepy==2019.1->-r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 1)) (2017.1)
Collecting blosc (from pyrevolve>=2.1.3->-r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 3))
Using cached https://files.pythonhosted.org/packages/6d/3b/2b707cd330a205ba5c69b5e8bfa9c05691442e45ce9ce882c4c8d343e61a/blosc-1.8.1.tar.gz
Collecting contexttimer (from pyrevolve>=2.1.3->-r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 3))
Requirement already satisfied, skipping upgrade: decorator>=3.2.0 in /home/a/.conda/envs/devito/lib/python3.7/site-packages (from pytools>=2015.1.2->codepy==2019.1->-r /home/code/lapps/devito/condaenv.ioy84c8f.requirements.txt (line 1)) (4.4.0)
Building wheels for collected packages: pyzfp, pyrevolve, codepy, blosc
Building wheel for pyzfp (setup.py): started
Building wheel for pyzfp (setup.py): finished with status 'error'
Running setup.py clean for pyzfp
Building wheel for pyrevolve (setup.py): started
Building wheel for pyrevolve (setup.py): finished with status 'error'
Running setup.py clean for pyrevolve
Building wheel for codepy (setup.py): started
Building wheel for codepy (setup.py): finished with status 'done'
Stored in directory: /tmp/pip-ephem-wheel-cache-m64odali/wheels/8b/e5/f8/5fa48f28841d0433a91e37d17a60fb9d8d5d20e603ebe4419b
Building wheel for blosc (setup.py): started
Building wheel for blosc (setup.py): still running...
Building wheel for blosc (setup.py): finished with status 'error'
Running setup.py clean for blosc
Successfully built codepy
Failed to build pyzfp pyrevolve blosc
Installing collected packages: pyzfp, blosc, contexttimer, pyrevolve, py-cpuinfo, anytree, codepy
Running setup.py install for pyzfp: started
Running setup.py install for pyzfp: finished with status 'done'
Running setup.py install for blosc: started
Running setup.py install for blosc: still running...
Running setup.py install for blosc: finished with status 'done'
Running setup.py install for pyrevolve: started
Running setup.py install for pyrevolve: finished with status 'done'
Successfully installed anytree-2.6.0 blosc-1.8.1 codepy-2019.1 contexttimer-0.3.3 py-cpuinfo-5.0.0 pyrevolve-2.1.3 pyzfp-0.3
#
# To activate this environment, use
#
# $ conda activate devito
#
# To deactivate an active environment, use
#
# $ conda deactivate
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