『reset-shortcut-icons.js』へフォルダをドラッグ&ドロップすることで、Windowsのショートカットファイル (.lnk) について、アイコンがリンク切れしている、またはアイコンのパスがリンク先と一致するショートカットファイルのアイコンをリセットします。 ※右の「Raw」ボタンからダウンロードすると文字化けを回避できます

reset-shortcut-icons.js

/**
 * @file 『reset-shortcut-icons.js』へフォルダをドラッグ&ドロップすることで、Windowsのショートカットファイル (.lnk) について、アイコンがリンク切れしている、またはアイコンのパスがリンク先と一致するショートカットファイルのアイコンをリセットします。 
 * @version 1.0.1
 * @license MPL-2.0
 * @author 100の人
 * @see {@link https://gist.github.com/esperecyan/a195f0195b0ae7c48c1a066e44dfeef2}
 */

var FileSystemObject = WSH.CreateObject('Scripting.FileSystemObject');
var Shell = WSH.CreateObject('WScript.Shell');

/**
 * @param {string} path - ショートカットファイルのパス。
 * @returns {boolean} アイコンのリセットを行った場合は `true`。
 */
function resetIcon(path)
{
	if (FileSystemObject.GetExtensionName(path) !== 'lnk') {
		// ショートカットファイルでなければ
		return false;
	}

	var shortcut = Shell.CreateShortcut(path);
	if (!FileSystemObject.FileExists(shortcut.TargetPath)) {
		// ショートカットファイルのリンク先が存在しなければ
		return false;
	}

	var iconLocation = /^(.*),(-?[0-9]+)$/.exec(shortcut.IconLocation);
	var iconFilePath = Shell.ExpandEnvironmentStrings(iconLocation[1]);
	var iconIndex = iconLocation[2];
	if (iconFilePath === ''
		|| shortcut.TargetPath !== iconFilePath && FileSystemObject.FileExists(iconFilePath)) {
		// アイコンが設定されていない、またはリンク先と同一ではないアイコンファイルが存在すれば
		return false;
	}

	shortcut.IconLocation = ',' + (shortcut.TargetPath === iconFilePath ? iconIndex : '0');
	shortcut.Save();

	return true;
}

var paths = [];
for (var i = 0; i < WSH.Arguments.length; i++) {
	if (FileSystemObject.FileExists(WSH.Arguments.Item(i))) {
		if (!resetIcon(WSH.Arguments.Item(i))) {
			continue;
		}
		paths.push(WSH.Arguments.Item(i));
	} else {
		var folders = [FileSystemObject.GetFolder(WSH.Arguments.Item(i))];
		for (var folder; folder = folders.shift(); ) {
			for (var fs = new Enumerator(folder.SubFolders); !fs.atEnd(); fs.moveNext()) {
				folders.push(fs.item());
			}

			for (var files = new Enumerator(folder.Files); !files.atEnd(); files.moveNext()) {
				var path = files.item().Path;
				if (!resetIcon(path)) {
					continue;
				}

				paths.push(path);
			}
		}
	}
}

WSH.Echo('次のショートカットファイルのアイコンをリセットしました。\n\n' + paths.join('\n'));