これの回答がすべてだった: http://stackoverflow.com/questions/16702420/bigquery-add-columns-to-table-schema
現在のスキーマをダウンロード:
bq --format=prettyjson show yourdataset.yourtable > table.json
-> table.json を編集: fields の中身だけ ([ { "name": "x" ... }, ... ]
) 残して全て消す.
{"schema": ...}
でも {"fields": [...]}
でもなく、本当に [ {"name": "x" ... }, ... ]
の部分だけを残す。