gist:3978621 の問題を単純化してみた。まあ仕方ないのかなあ。

foo.cc

#include <iostream>

void set_value(int new_value);

struct Foo
{
  Foo()
  {
    set_value(1);
  }
};

Foo foo;

main.cc

#include <iostream>

int value;

void set_value(int new_value)
{
  value = new_value;
}

int main()
{
  std::cout << value << std::endl;
  return 0;
}

Makefile

CXX = g++
CXXFLAGS = -Wall -O0 -g
CPPFLAGS =
AR = ar
LD = g++
LDFLAGS =
LIBS =
RM = rm -f

all: ok ng

clean:
	$(RM) ok ng
	$(RM) libfoo.a
	$(RM) main.o foo.o

ok: main.o foo.o
	$(LD) $(LDFLAGS) -o $@ main.o foo.o

ng: main.o libfoo.a
	$(LD) $(LDFLAGS) -o $@ main.o -L. -lfoo

main.o: main.cc
	$(CXX) $(CXXFLAGS) -o $@ -c $<

foo.o: foo.cc
	$(CXX) $(CXXFLAGS) -o $@ -c $<

libfoo.a: foo.o
	$(RM) $@; $(AR) crs $@ foo.o