Εισαγωγή στον προγραμματισμό με τη γλώσσα python 2017-2018, διάλεξη 9η

lesson_9.ipynb

Όσοι κάνετε την άσκηση με pandas (που είναι μια καλή ιδέα) η παρακάτω εντολή μετατρέπει το column DATE από string σε Date format

data['DATE'] = pd.to_datetime(data['DATE'], format='%Y-%m-%d')

Παρατηρούμε ότι το INITIAL SAMPLE SIZE περιέχει text από το οποίο πρέπει να "εξάγουμε" κάποιο νούμερο. Μπορείτε να χρησιμοποιήσετε αυτή τη μέθοδο για να το κάνετε αυτό:

import re
import pandas as pd

def convert(x):
    # Get the first number
    s = re.search(r'[\d,\.]', x)
    if not s:
        print ('Warning. Could not find a number at the field:', x)
        return 0
    
    #Remove commas
    found = s.group(0).replace(',', '').replace('.', '')
    if not found:
        print ('Warning: Could not parse:', x)
        return 0
    return int(found)

df = pd.read_csv('gwas_catalogue.tsv', sep='\t', converters = {
    'INITIAL SAMPLE SIZE': convert})