YouTube における動画の再生には一般に Flash Player が使用されていますが、HTML5 プレイヤーのトライアルにオプトインすることにより、Flash Player が無くてもコンテンツの再生が可能になります。ただし、一部のコンテンツ（広告入りの動画？）においては、この機能は無効化されており、Flash Player のインストールを強制されます。
ちょっと迂遠で分かり難いですが、YouTube の HTML5 プレイヤーを封印してから ClickToPlugin 拡張をインストールすれば、これを回避できます。
以下の URL （直リンク）からインストールします。
https://github.com/downloads/hoyois/safariextensions/DisableYouTubeHTML5.safariextz
ちなみに、この拡張は次の ClickToPlugin のオマケとして用意されているものです。
以下のページから ClickToPlugin 拡張をダウンロードしてインストールします。
http://hoyois.github.com/safariextensions/clicktoplugin/
デフォルト設定のままでも、とりあえず観れます。