gistfile1.txt

(larva)kwilcox@terrapin:~/Development/paegan-transport (master)$ py.test -s -k test_run_from_multiple_files_without_cache
================================================================ test session starts ================================================================
platform linux2 -- Python 2.7.6 -- py-1.4.28 -- pytest-2.7.1
rootdir: /home/kwilcox/Development/paegan-transport, inifile: 
collected 106 items 

tests/test_model_controller.py test_model_controller.ModelControllerTest.test_run_from_multiple_files_without_cache
*** BaseModelController ***

            ***** Transport *****
              horizDisp: 0.05
              vertDisp:  0.0003
            
(1, 'Setting up particle start locations')
(2, 'Initializing particles')
(3, "Initializing and caching hydro model's grid /data/lm/tests/pws_das_2014*.nc")
(4, 'Starting tasks')
child process calling self.run()
child process calling self.run()
child process calling self.run()
child process calling self.run()
child process calling self.run()
child process calling self.run()
child process calling self.run()
Adding 4 particles as tasks
child process calling self.run()
Waiting for 4 particle results
(5, 'Running model')
Particle 0 Stats:                           Data read: 0.067876                           Model forcing: {'Transport': 0.00826799999999997}                           Boundary intersection: 0.000129
Particle 1 Stats:                           Data read: 0.068546                           Model forcing: {'Transport': 0.008627999999999955}                           Boundary intersection: 0.000126
(22.5, '1 Particle(s) complete')
(45.0, '2 Particle(s) complete')
Particle 2 Stats:                           Data read: 0.113709                           Model forcing: {'Transport': 0.012792999999999999}                           Boundary intersection: 0.000199
Particle 3 Stats:                           Data read: 0.101484                           Model forcing: {'Transport': 0.01111699999999996}                           Boundary intersection: 0.000167
(67.5, '3 Particle(s) complete')
(90.0, '4 Particle(s) complete')
[<paegan.transport.particles.particle.LarvaParticle object at 0x7f074b2e4dd0>, <paegan.transport.particles.particle.LarvaParticle object at 0x7f074b2e4d50>, <paegan.transport.particles.particle.LarvaParticle object at 0x7f074b2d7e90>, <paegan.transport.particles.particle.LarvaParticle object at 0x7f074b2e4a50>]
Tasks are all finished... Cleaning up!!
(96, 'Exporting results')
Exporting to: <class 'paegan.transport.export.H5Trackline'>
(97, 'Model Run Complete')
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.test_model_controller.ModelControllerTest.test_run_from_multiple_files_without_cache_on_ipy_cluster
s

====================================== 104 tests deselected by '-ktest_run_from_multiple_files_without_cache' =======================================
================================================ 1 passed, 1 skipped, 104 deselected in 1.59 seconds ================================================
process shutting down
process shutting down
process shutting down
process shutting down
process shutting down
process shutting down
(larva)kwilcox@terrapin:~/Development/paegan-transport (master)$ py.test -s -k test_run_from_multiple_files_with_cache
================================================================ test session starts ================================================================
platform linux2 -- Python 2.7.6 -- py-1.4.28 -- pytest-2.7.1
rootdir: /home/kwilcox/Development/paegan-transport, inifile: 
collected 106 items 

tests/test_model_controller.py test_model_controller.ModelControllerTest.test_run_from_multiple_files_with_cache
*** CachingModelController ***

            ***** Transport *****
              horizDisp: 0.05
              vertDisp:  0.0003
            
(1, 'Setting up particle start locations')
(2, 'Initializing particles')
(3, "Initializing and caching hydro model's grid /data/lm/tests/pws_das_2014*.nc")
child process calling self.run()
created temp directory /tmp/pymp-AHqG_1
manager serving at '/tmp/pymp-AHqG_1/listener-zTh5yZ'
(4, 'Starting tasks')
Starting CachingDataController
Adding 4 particles as tasks
child process calling self.run()
Started CachingForcer-0
Started CachingForcer-1
Started CachingForcer-2
Started CachingForcer-3
Waiting for 4 particle results
(5, 'Running model')
child process calling self.run()
child process calling self.run()
child process calling self.run()
child process calling self.run()
Waiting for DataController to start...
Waiting for DataController to start...
Waiting for DataController to start...
Waiting for DataController to start...
(datetime.datetime(2015, 6, 4, 20, 0, 9, 653692, tzinfo=<UTC>), 5, 'Running model')
Particle 1 Stats:                           Data read: 0.588197                           Model forcing: {'Transport': 0.013094999999999996}                           Boundary intersection: 0.005272
Particle 3 Stats:                           Data read: 0.590818                           Model forcing: {'Transport': 0.013179000000000135}                           Boundary intersection: 0.005174
Particle 1 finished
(22.5, 'Particle 1 finished')
Retrieved 1/5 results
Particle 3 finished
(45.0, 'Particle 3 finished')
Retrieved 2/5 results
Particle 0 Stats:                           Data read: 0.666977                           Model forcing: {'Transport': 0.014537999999999968}                           Boundary intersection: 0.005587
Particle 2 Stats:                           Data read: 0.669091                           Model forcing: {'Transport': 0.013473999999999903}                           Boundary intersection: 0.005695
Particle 0 finished
(67.5, 'Particle 0 finished')
Retrieved 3/5 results
Particle 2 finished
(90.0, 'Particle 2 finished')
Retrieved 4/5 results
CachingDataController finished
(112.5, 'CachingDataController finished')
Retrieved 5/5 results
Joining the task queue
Joining the processes
(datetime.datetime(2015, 6, 4, 20, 0, 15, 892060, tzinfo=<UTC>), 112.5, 'CachingDataController finished')
No tasks left to complete, closing CachingForcer-1
process shutting down
No tasks left to complete, closing CachingForcer-3
process shutting down
process exiting with exitcode 0
process exiting with exitcode 0
No tasks left to complete, closing CachingForcer-0
process shutting down
process exiting with exitcode 0
No tasks left to complete, closing CachingForcer-2
process shutting down
process exiting with exitcode 0
No tasks left to complete, closing CachingDataController
process shutting down
process exiting with exitcode 0
Tasks are all finished... Cleaning up!!
(96, 'Exporting results')
Exporting to: <class 'paegan.transport.export.H5Trackline'>
(97, 'Model Run Complete')
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======================================== 105 tests deselected by '-ktest_run_from_multiple_files_with_cache' ========================================
===================================================== 1 passed, 105 deselected in 17.49 seconds =====================================================
process shutting down
sending shutdown message to manager
calling join() for process SyncManager-1
manager exiting with exitcode 0