gistfile1.js

d3.json(uri, function(json) {
  var myData = data();

  force
    .nodes(myData.nodes)
    .links(myData.links)
    .start();

  var link = svg.selectAll("line.link")
    .data(force.links())
    .enter().append("line")
    .attr("class", "link")
    .style("stroke-width", function(d) { return Math.sqrt(d.value); });

  var node = svg.selectAll("circle.node")
    .data(force.nodes())
    .enter().append("circle")
    .attr("class", "node")
    .attr("r", nodeSize)
    .attr("cx", width / 2)
    .attr("cy", height / 2)
    .call(force.drag);

  var text = svg.selectAll("text.text")
    .data(force.nodes())
    .enter().append("text")
    .attr("class", "label")
    .text(function(d) { return d.id; });

  force.on("tick", function() {
    link
      .attr("x1", function(d) { return d.source.x; })
      .attr("y1", function(d) { return d.source.y; })
      .attr("x2", function(d) { return d.target.x; })
      .attr("y2", function(d) { return d.target.y; });

    node
      .attr("cx", function(d) { return d.x; })
      .attr("cy", function(d) { return d.y; });

    text
      .attr("x", function(d) { return d.x; })
      .attr("y", function(d) { return d.y; })
  });
});