###assume-unchanged ファイルの変更を無視する。
git update-index --assume-unchanged filename
###no-assume-unchanged この設定を取り消す。
git update-index --no-assume-unchanged filename
###設定確認
git ls-files -v
大文字になっているときは普通にgitで管理している。 小文字担っている時、assume-unchangedが効いていて、そのファイルに変更を加えても変更を無視する。
元情報: http://qiita.com/items/56d0d3ba7a1300625f92