Comando: npm
Archivo: package.json
Dependencias necesarias para la producción. Para instalar las dependencias definidas en package.json, usar npm install.
Comando: bower
Archivo: bower.json
Dependencias de la propia aplicación. JQery, etc... Para instalar las dependencias definidas en bower.json, usar bower install. Ejemplo instalación + añadir paquete a bower.json: bower install angular --save.