Linuxで動作確認済みです。
まずvirtualenvでpipで必要なライブラリをインストールします。fugashiを使用していますがこの場合mecab-python3でも変わりません。
# MeCab関係
pip install fugashi unidic-lite
# EXEを作成するやつ
pip install pyinstaller
次は適当なスクリプトを準備します。
# hoge.py
import fugashi
tagger = fugashi.Tagger("-O wakati")
try:
while True:
print(tagger.parse(input(" > ")))
except EOFError:
pass
最後にexeを作成します。辞書は直接import
しないため指定方法がやや分かりづらいです。
pyinstaller --collect-data unidic_lite --hidden-import unidic_lite hoge.py
これでdist/hoge/hoge
にバイナリが出来上がります。