gistfile1.py

#!/usr/bin/env python
from optparse import OptionParser

class Hoge(object):
    def __init__(self):
        parser = OptionParser()
        parser.add_option("-f", "--foo", action="store_true", dest="foo", default=False,
                           help="Foo")
        (self.options, self.args) = parser.parse_args()

    def run(self):
        print self.options
        print self.args

if __name__ == "__main__":
    hoge = Hoge()
    hoge.run()

簡単なスクリプトなら、いちいちクラスを作るのはちょっとやり過ぎな感じ。

#!/usr/bin/env python
from optparse import OptionParser

def make_parser():
    parser = OptionParser()
    parser.add_option("-f", "--foo", action="store_true", help="Foo")
    return parser

def main():
    parser = make_parser()
    opts, args = parser.parse_args()
    print opts
    print args

if __name__ == '__main__':
    main()

dest は指定しなくても、勝手に long なオプション名があればそれを、無ければ short なオプション名を使ってくれます。
default を指定しない場合、勝手に None が入るので、 if opts.foo: と分岐を書けばデフォルトで偽になります。
アンパック代入の左辺は括弧不要です。

勉強になります！ありがとうございます！！！