Usando react-engine con react-router para el ruteo.

1.server.js

import express from 'express';
import engine from 'react-engine';
import path from 'path';

const app = express();
// acá indicamos la ubicación de nuestro archivo con las rutas
app.engine('.jsx', engine.server.create({
  reactRoutes: path.join(__dirname, 'routes.jsx')
}));
app.set('views', path.join(__dirname, 'views'));
app.set('view engine', 'jsx');
app.set('view', engine.expressView);

// definimos nuestra ruta en el servidor, al pasar req.url como primer
// parámetro de res.render react-engine usa react-route para
// renderizar la ruta que corresponda, como segundo parámetro podríamos
// pasar un objeto con los datos (props) que queramos pasar a nuestra vista.
app.get('/', (req, res) => {
  res.render(req.url, {
    title: 'Titulo'
  });
});

app.listen(3000);

2.routes.jsx

import React from 'react';
import Router from 'react-router';
// componentes
import App  from './views/app';
import Home from './views/home';

// configuramos nuestras rutas
const routes = (
  <Router.Route path='/' handler={ App }>
    <Router.DefaultRoute name='home' handler={ Home } />
  </Router.Route>
);

export default routes;

3.client.js

// importamos nuestro archivo de rutas
import routes from './routes.jsx';
// importamos la librería para el navegador de react-engine
import Client from 'react-engine/lib/client';

// por último una vez es listo el DOM iniciamos nuestra aplicación en el navegador
// usando react-engine el cual va a usar react-routes para las rutas en el navegador
document.addEventListener('DOMContentLoaded', function onLoad() {
  // iniciamos el cliente de react-engine pasandole como parámetro un objeto con
  // una propiedad routes igual a las rutas que cargamos de nuestro archivo de rutas
  Client.boot({ routes });
});

4.app.jsx

import React from 'react';
import Layout from './layout.jsx';
import { RouteHandler } from 'react-router';

const App = React.createClass({
  render() {
    return (
      <Layout { ...this.props }>
        <main role="application" className="App" id="app">
          {/* Esta es la parte más importante, acá react-router va inicilizarse
              y a cargar las vistas de cada ruta */}
          <Router.RouteHandler { ...this.props } />
        </main>
      </Layout>
    );
  }
});

export default App;

5.home.jsx

import Header   from '../components/header.jsx';
import React    from 'react';
import { Link } from 'react-router';

const Home = React.createClass({
  render() {
    return (
      <header>
        <h1>{ this.props.title }</h1>
        {/* este link es para que react-router funcione como una SPA */}
        <Link to="home">Home</Link>
      </header>
    );
  }
});

export default Home;