非負の数値の配列とBase64を相互変換

array_base64.js

function fromIntArray(array) {
  var str = '';
  var octet = new Uint8Array(new Uint32Array(array).buffer);
  for (var i = 0; i < octet.length; i++) {
    str += String.fromCharCode(octet[i]);
  }
  return btoa(str);
}

function toIntArray(ascii) {
  var binary = atob(ascii);
  var octet = new Uint8Array(binary.length);
  for (var i = 0; i < binary.length; i += 1) {
    octet[i] = binary.charCodeAt(i);
  }
  return new Uint32Array(octet.buffer);
}

取り扱う数値が２バイトで収まるのなら Uint32Array を Uint16Array にすればよい。