custom_toc2.tex

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\documentclass[a4paper,dvipdfmx]{jsarticle}
\usepackage{bxjalipsum}

% \enabletoc するまで何も目次に表示させない
\setcounter{tocdepth}{-2}

% 目次記載を始めたい位置で \enabletoc を宣言する
\newcommand{\enabletoc}{%
  % tocdepth カウンタの値はお好きなように
  \addtocontents{toc}{\setcounter{tocdepth}{2}}}

\begin{document}

\tableofcontents

\section{ほげ}

\jalipsum[1-5]{wagahai}

\enabletoc % <----- この例では，ここで宣言

\section{ふが}

\jalipsum[6-10]{wagahai}

\section{ぴよ}

\jalipsum[11-15]{wagahai}

\end{document}