Esse texto é baseado em um passo a passo criado originalmente por Jonathan Zanella. Mais detalhes foram adicionados posteriormente através de consultas rápidas na internet. Por favor, não se baseie nesse texto para tomar qualquer decisão.
"Agora a turma grita: Pesquise, pois o mundo está em crise" - Luis Vagner
Você precisa justificar pra Receita Federal de onde está vindo o seu novo salário (dinheiro). Já que não é possível fazer um contrato CLT, você precisa emitir uma NF referente ao serviço que você está prestando. Tecnicamente, você não precisa ter um CNPJ, você pode emitir NFs como pessoa física e recolher no imposto de renda, só que sai mais caro (mais impostos).